Il curriculum del programma di studio Odontoiatria è identico a quello perseguito dagli studenti di medicina cechi, a parte l'insegnamento in inglese. È conforme agli standard dell'Unione Europea.

Il corso di studio soddisfa i requisiti della Direttiva 2005/36/CE del Parlamento Europeo e del Consiglio del 7 settembre 2005 relativa al riconoscimento delle qualifiche professionali (tale atto è stato modificato, attuale versione consolidata: 24/04/2020), che applicare alla professione regolamentata "veterinario". Il corso di laurea magistrale in Igiene ed ecologia veterinaria corrisponde allo stato attuale e al livello della scienza e alle esigenze della pratica in Europa. Lo studio contiene conoscenze teoriche e consente l'acquisizione delle competenze pratiche necessarie per lo svolgimento della professione, compreso l'impiego in attività creative, e prepara anche gli studenti allo studio in un programma di studi di dottorato.

Il curriculum di 6 anni porta al Master MUDr. - "Medicinae Universae Doctor" = Dottore in Medicina Generale. Ai sensi della seconda frase dell'articolo 3, sottosezione 1 del codice di procedura di ammissione per i candidati per gli studi presso l'Università Charles, questo è un programma di studio senza specializzazione.

Il programma di studio è conforme alla direttiva UE 2005/36/CE sull'istruzione superiore dei farmacisti e il laureato è abilitato all'esercizio delle attività di farmacista elencate in questa direttiva (1) La preparazione della forma farmaceutica dei medicinali. (2) La fabbricazione e l'analisi dei medicinali. (3) La prova dei medicinali in un laboratorio per la prova dei medicinali. (4) Lo stoccaggio, la conservazione e la distribuzione dei medicinali nella fase di vendita all'ingrosso. (5) La preparazione, l'analisi, la conservazione e la fornitura di medicinali nelle farmacie aperte al pubblico. (6) La preparazione, l'analisi, la conservazione e la dispensazione dei medicinali negli ospedali. (7) La fornitura di informazioni e consulenza sui medicinali.

La Fisioterapia Applicata è una disciplina in un'area sanitaria focalizzata sulla diagnostica e sulla terapia funzionale dei disturbi del sistema motorio. La fisioterapia influenza anche le funzioni degli altri sistemi compreso quello psichico attraverso il movimento e gli altri processi fisioterapici. Gli studenti di questo programma sono laureati in programmi di studio di fisioterapia accreditati/riconosciuti nella Repubblica Ceca. I laureati di qualsiasi università all'estero (a parte la Slovacchia) sono tenuti a completare il processo di nostraficazione. Il programma offre un programma di studio di 2 anni. Il programma è suddiviso in 4 semestri e comprende materie che intensificano e sviluppano le conoscenze e le competenze acquisite durante il percorso di studi Bachelor. Gli studenti si specializzano in almeno un metodo o concetto specifico in fisioterapia. Le materie essenziali includono Kinesiologia speciale, Diagnostica differenziale, Capitoli selezionati di metodi fisioterapeutici, PNF applicato, Efficacia clinica in fisioterapia, Capitoli speciali di argomenti clinici, Management in sanità, Fisioterapia nello sport, Programmi preventivi in fisioterapia, Metodologia della scienza, Presentazione dei risultati del lavoro scientifico. La parte importante dello studio di ogni anno è uno stage specializzato presso istituzioni mediche, uno stage curriculare e un colloquio clinico sotto la supervisione di esperti. Quando lo studente ottiene 120 crediti ECTS, sostiene l'esame di stato finale che comprende la difesa della tesi di master, gli esami teorici e l'esame pratico dell'istituto medico.

La Facoltà di Medicina a Pilsen offre corsi in Medicina Generale (sei anni) e Odontoiatria (cinque anni) sia in ceco e in lingua inglese. Per gli studenti di medicina, i primi due anni di studio sono dedicate alle discipline teoriche, come Anatomia, Istologia, embriologia, Biofisica, Biochimica e Fisiologia.

Il programma di 5 anni di Odontoiatria porta al Master MDDr. - "Medicinae Dentium Doctor" = Dottore in Medicina Dentale. Ai sensi della seconda frase dell'articolo 3, sottosezione 1 del codice di procedura di ammissione per i candidati per gli studi presso l'Università Charles, questo è un programma di studio senza specializzazione.

Il programma di studio di Scienze farmaceutiche pone l'accento in particolare sullo studio delle discipline farmaceutiche come chimica farmaceutica, analisi farmaceutica, farmacologia, farmaci naturali e forme di farmaci, in particolare la conoscenza dell'analisi farmaceutica e della ricerca sui farmaci. È un programma master di follow-up della durata di due anni. specializzazioni non fanno parte del piano di studi.

Il ramo di studio Biomedical Engineer prepara, nell'ambito del programma di studi Biomedical and Clinical Technology, soprattutto laureati con orientamento pratico e futuri studenti dei programmi di studio di dottorato successivi presso la FBME CTU ma anche presso altre università della Repubblica Ceca e all'estero.